囊肿是否会自行消失，取决于囊肿的类型、大小及具体成因，多数功能性卵巢囊肿可能在数周到数月内自行吸收，但其他类型的囊肿，如巧克力囊肿或皮样囊肿，通常不会自行消失，且可能需要进一步治疗。

功能性囊肿与月经周期有关，常是正常生理变化的一部分，这类囊肿通常在数次月经后逐渐缩小直至消失。相比之下，病理性囊肿如巧克力囊肿（子宫内膜异位囊肿）和皮样囊肿（成熟性畸胎瘤）可能持续增长，引发疼痛、不规则出血或压迫症状。感染性囊肿通常由炎症引起，早期用抗生素治疗可能有效，但严重时可能发展为脓肿，需外科处理。多囊卵巢综合征伴随多发性小囊肿，这种情况通常不会依靠自身恢复，需通过生活方式调整与药物干预稳定。

对于可自行吸收的功能性囊肿，保持健康的生活方式可能有助于自然恢复，可适当补充含维生素E的食物如坚果和菠菜，以抗氧化缓解不适。病理性囊肿则通常需要医疗干预，小型囊肿可以药物控制，如激素类药物（达英35、孕激素类药物）帮助平衡激素水平。对于持续增大或症状严重的囊肿，可能需要手术治疗，如腹腔镜手术能有效清除囊肿，且创伤较小。若囊肿疑有恶性变，则可能需要通过剖腹手术彻底切除并进行病理分析。

为避免囊肿对生活的进一步影响，建议定期做妇科检查（如B超）监测囊肿变化。如果出现腹痛、月经异常、腹胀等症状，应尽早就医以明确具体病因并获得恰当治疗。同时，注意控制体重、避免熬夜、减少高糖食物摄入，维持内分泌平衡，降低囊肿复发或恶化的风险。