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1、牡丹江医学院附属第二医院
牡丹江医学院附属第二医院在技术、服务、环境、设备、临床教学等方面等都实现了跨越式发展，现已发展成为实力雄厚的综合性临床教学医院，是牡丹江医学院人才培养、科学研究、成果产出及社会服务的重要基地。经过六十六载的风雨沉浮，牡丹江医学院附属第二医院始终把医疗设备投入和环境建设定位在国内现代化医院标准。几经更新换代，我院大部分仪器，设备已达到国内先进水平。目前医院拥有的诊疗设备有：德国西门子256排双源CT、美国GE3100数字减影血管造影机、彩色超声诊断仪、法国产的肌电图机、碎石机、GET30四维彩色超声、全自动生化分析仪及全科手术显微镜等大型设备。最先建立了黑龙江省东部地区最先进的内镜检查室、ICU（术后监护室）。血液透析中心拥有先进的德国水处理系统、德国的费森透析机以及日本的NIPRO-12透析机。医院新外科大楼、教学综合楼拔地而起。庭院建设花园式，整洁幽静。病房设计规范，装修别致，闭路电视、网络终端、电话、呼叫系统、室内卫生间等设施齐全。为了适应医学科技发展的需要，满足病人的健康需求，医院将加大购置和更新医疗设备的资金，不断提高医院的医疗水平。医院拥有现代化的医疗设备和优雅的医疗环境，在具备综合医院开展的大型检查设备的基础上，医院还引进了牡丹江市最先进的1.5t核磁共振设备及四维彩超，近期又引进牡丹江市唯一一台超声内镜及西门子炫速双源CT。肝胆外科开展的腹腔镜保肝取石手术，填补了东北地区的技术空白。
2、牡丹江市中医医院
医院拥有德国西门子1.5T******磁共振仪、2台美国GE 64排128层螺旋CT、2台数字减影血管造影系统、美国GE、日本日立、意大利百胜等各类先进彩色超声诊断仪11台。进口奥林巴斯290电子内窥镜20条、高清腹腔镜1套、电子支气管镜2条，各类国内外先进康复设备20余台（套），全自动生化分析仪等检验设备21台，是省内医疗设备较好的中医医院之一。
3、黑龙江省牡丹江林业中心医院
医院先后引进许多高精尖医疗设备，如：美国GE公司产3.0T核磁共振机、美国GE256排全身螺旋CT、美国GE产数字减影血管造影机、日本产全自动开放式生化分析仪、美国GE公司生产飞天数字摄影系统（DR）、日本产电子胃肠镜、荷兰产飞利浦彩色超声诊断仪、上海产SHC900型单人纯氧舱、美国眼底激光治疗仪、放射性粒子植入系统等一批先进医疗设备。
4、牡丹江市第二人民医院
医院现有临床科室48个（普外一科、普外二科、骨外一科、骨外二科、手足显微外科、骨四烧伤科、神经外一科、神经外二科、泌尿外科、心胸外科、眼科、耳鼻喉科、口腔科、头颈乳腺科、妇科、产科、肛肠外一科、肛肠外二科、麻醉科、神经内一科、神经内二科、神经内三科、心内一科、心内二科、心内三科、呼吸内一科、呼吸内二科、消化一科、消化二科、肾内科、血液科、内分泌科、风湿免疫科、儿一科、儿二科、新生儿科、急诊科、重症医学科ICU、感染性疾病科、老年病科、肿瘤科、中医科、中西医结合科、康复科、针灸推拿科、透析室、皮肤科、疼痛科、静配中心、精神心理门诊），医技科室10个（影像科、物理诊断科、检验科、输血科、临床药学部、药学部、介入科导管室、第二导管室、病理科、腔境室）；其中，内分泌科、急诊医学科为市重点学科，神经内科、神经外科、骨外科、影像科、超声诊断科、心内科、儿科、风湿免疫科、妇产科为市重点专科，检验科为市重点实验室。