肩袖损伤后预防三角肌萎缩的方法为：在康复师的指导下进行正确的功能锻炼。
如果是保守治疗，在保守治疗初期就应进行功能锻炼。如果是手术治疗，则应循序渐进。功能锻炼应注意以下几个方面：首先要进行肩关节三角肌肌肉的前屈后伸的锻炼，主要是训练三角肌的前束和后束。由于冈上肌的原因，所以外展的时候要特别小心，一般都是在肩关节零度位的时候给予适当的抗阻，这种情况下进行肩关节三角肌肌肉外侧束的功能锻炼。这三角肌的前束、外侧束和后侧束都得到了及时、有效、正确的功能锻炼。所以在治疗肩袖损伤的时候，既可以避免由于功能锻炼带来肩袖损伤的再撕裂或者病情的加重，也可以避免由于害怕加重肩袖损伤，而不进行功能锻炼引起的三角肌肌肉的萎缩。